2000年2月，学校成立理学院，为物理学院前身，设应用数学系、应用物理系。

2024年5月，理学院物理系独立为物理学院。

人才培养

2000年，应用物理学本科专业开始招生。

2004年，光电信息科学与工程专业开始招生。

2020年，获批国家级一流专业2个：应用物理学、光电信息科学与工程。

第四届浙江省高等教育教学成果奖，一等奖（2001）

第五届浙江省高等教育教学成果奖，一等奖（2005） 

第六届浙江省高等教育教学成果奖，一等奖（2009）

第七届浙江省高等教育教学成果奖，一等奖（2014）

第七届国家级教学成果奖，二等奖（2014）

第八届浙江省高等教育教学成果奖，一等奖（2016）

第九届浙江省高等教育教学成果奖，特等奖（2021）

2009年，基础物理系列课程教学团队被评为国家级教学团队。

2012年，国家级物理实验教学示范中心通过教育部验收。

学科建设

2003年，获批“光学”二级学科硕士点。

2005年，获批“光学工程”一级学科专业学位硕士点。

2010年，获批“光学工程”专业硕士授予权。

2010年，获批“物理学”一级学科硕士点。

2015年，诺贝尔物理学奖获得者维尔切克教授受聘量子中心首席科学家。

2016年，物理学入选省一流学科（B）。

2020年，获批省级科研平台：浙江省量子精密测量重点实验室、省级协同创新中心。

2021年，获批博士点：物理学、电子信息（物理学院为光学工程方向） 。

2021年，乐孜纯教授当选乌克兰国家科学院外籍院士。

2022年物理学入选“浙江省一流学科（A类）”。

2024年，浙江省量子精密测量重点实验室被认定为首批标杆全省重点实验室（省内共15家）。

科学研究

2012年，首获省科学技术奖二等奖1项。

2020年，首次获得国家自然科学基金重点项目。

2020年，首次获浙江省技术发明一等奖。

2022年，获浙江省自然科学奖三等奖二项。

党的建设

2022年，理论物理党支部入选全国第三批党建工作样板支部创建培育单位。